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一般万吨级以下的生物柴油的生产工艺采用的是间歇工艺，但是对于万吨级以上的生物柴油的生产，采用连续法碱催化工艺显得至关重要。开发连续法工艺生产生物柴油，对于生物柴油的生产成本的降低、工业规模化生产、产业的发展有着非常重要的作用。
现介绍一种连续碱催化生物柴油的生产工艺，供大家参考。
该生物柴油的生产工艺包括四个主要单元：毛油脱胶、精练和干燥；油脂的转酯化反应；甲酯的洗涤、干燥；过量甲醇回收和甘油精制。如果生物柴油的生产原料来源比较广泛的话，可以增加处理高含游离脂肪酸原料的酸催化预处理单元。
1 、毛油脱胶、精练和干燥单元
将毛油通过酸脱胶除去水份和水不溶性磷脂，使之形成胶质物，然后分离除去。采用碱炼的方法除去毛油中的游离脂肪酸。经真空干燥器干燥后送入转酯化单元。
2 、转酯化反应单元
将精炼油送入 CSTR1 ＃反应釜中保持一定的温度，过量的甲醇随同甲醇钠催化剂一起加入到反应器中，在甲醇钠催化作用下甘三酯和甲醇之间发生转酯化反应生成生物柴油和副产物甘油。同时残留在精炼油中的游离脂肪酸同甲醇钠反应生成皂和甲醇。将反应后产物用滗析器分离出甘油相（甘油、甲醇、甲醇钠）和酯相（甲酯、未反应油、甲醇、皂）。然后将分离出的酯相送入到 CSTR2 ＃反应釜中，甘油相则打到收集罐中。在第二级的反应中同第一级一样重复进行，然而过量甲醇的加入量是根据第一级反应中未反应的甘三酯量计算的。从二级分离器中分离出来的酯相打到酯的洗涤干燥单元进行处理，
甘油则打到收集罐中。
3 、甲酯的洗涤、干燥单元
将转酯化反应后的甲酯送入到洗涤塔中，用温软水对酯进行洗涤，除去酯中残留的甲醇、皂和游离甘油。洗涤后的酯送入到沉降槽中沉降分离出洗涤后的酯。最后将酯送入到真空干燥器中将酯中残留的痕量湿性物质除去。干燥后的酯经冷却后加入抗氧化剂成为成品生物柴油。
4 、甲醇回收和甘油精制单元
将上述各工段中收集到的甘油 - 水 - 甲醇溶液在加热器中加热到甲醇的沸点温度，在甘油 - 甲醇汽提塔中用过热蒸汽将甲醇从混合物中汽提出来，饱和甲醇蒸汽和部分液体进入甲醇蒸馏塔中提纯，甲醇蒸汽经冷凝后循环到 CSTR 。蒸馏塔底物含有甘油、冷凝水和其它杂质。热甘油溶液从汽提塔底部送到粗甘油收集罐中。将收集罐中的粗甘油在酸化釜中混合一定比例的盐酸溶液，在酸化反应中，物料中的甲醇钠催化剂与盐酸反应生成甲醇和 NaCl ，残留皂同盐酸反应生成游离脂肪酸和 NaCl 。用滗析器将甘油产品从游离脂肪酸和其它杂质（如未反应油等）中分离出来，然后进行精制，可以制成医用级和工业级甘油产品。
对于使用废油和动物脂生产生物柴油，必须对这些原料进行非常必要的预处理，才能使用碱催化工艺进行转酯化处理
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